Проверьте наличие свободного места на сервере/хостинге. Часто так бывает что место закончилось, а продолжает сохранятся различный кеш, ошибки итп и приводит и к таким симптомам в том числе.
По поводу увеличения количества передаваемых при сохранении данных , можно прописать в .htaccess ( можно в самом конце файла ) следующую строчку:
php_value max_input_vars 5000
При чём значение 5000 можете увеличить на своё усмотрение.
Другой вариант попросить увеличить это значение у т/п хостинга.