Всё гораздо проще.
1) Берём БД со старого сайта
2) Заливаем чистый дистрибутив сборки
3) Потом заливаем рабочие config.php и admin/config.php
4) Идём в браузере https://{ваш сайт}/install
5) Будет предложено сделать обновление.
Всё. В процессе обновления вся БД будет приведена к нужному виду, в том числе и по индексам.
И не надо что-то изобретать и мучаться.