это к сборке отношения не имеет, и скорее из разряда про кнопку "бабло"
потому что у каждого разработчика свой механизм и алгоритмы защиты
кто-то использует ioncube, у других кастомная защита на нативном php
у кого-то связь с сервером и возможностью смены лицензий, у кого-то лицензия безотзывная
у кого-то работает на домен+все его поддомены, у других - индивидуально и тд
вариантов масса, а нюансов еще больше